Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NICN1Q9BSH3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NICN1Q9BSH3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NICN1Q9BSH3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NICN1Q9BSH3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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