Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GORASP1Q9BQQ3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GORASP1Q9BQQ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GORASP1Q9BQQ3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GORASP1Q9BQQ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GORASP1Q9BQQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms