Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
BPIFA3Q9BQP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BPIFA3Q9BQP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BPIFA3Q9BQP9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BPIFA3Q9BQP9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BPIFA3Q9BQP9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms