Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE6

LBHD1, LBH domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBHD1Q9BQE6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LBHD1Q9BQE6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
LBHD1Q9BQE6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
LBHD1Q9BQE6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LBHD1Q9BQE6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LBHD1Q9BQE6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LBHD1Q9BQE6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LBHD1Q9BQE6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LBHD1Q9BQE6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LBHD1Q9BQE6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LBHD1Q9BQE6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LBHD1Q9BQE6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms