Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PMCHL2Q9BQD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PMCHL2Q9BQD1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PMCHL2Q9BQD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms