Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NIPSNAP1Q9BPW8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NIPSNAP1Q9BPW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NIPSNAP1Q9BPW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms