Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3AQ99856 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ARID3AQ99856 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARID3AQ99856 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARID3AQ99856 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARID3AQ99856 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms