Protein–RNA interactions for Protein: Q96S99

PLEKHF1, Pleckstrin homology domain-containing family F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHF1Q96S99 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PLEKHF1Q96S99 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PLEKHF1Q96S99 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
PLEKHF1Q96S99 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PLEKHF1Q96S99 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PLEKHF1Q96S99 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PLEKHF1Q96S99 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PLEKHF1Q96S99 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PLEKHF1Q96S99 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PLEKHF1Q96S99 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PLEKHF1Q96S99 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PLEKHF1Q96S99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms