Protein–RNA interactions for Protein: Q96S42

NODAL, Nodal homolog, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NODALQ96S42 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NODALQ96S42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NODALQ96S42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NODALQ96S42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NODALQ96S42 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NODALQ96S42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms