Protein–RNA interactions for Protein: Q96QZ0

PANX3, Pannexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANX3Q96QZ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PANX3Q96QZ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PANX3Q96QZ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PANX3Q96QZ0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PANX3Q96QZ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms