Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PHF12Q96QT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PHF12Q96QT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PHF12Q96QT6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms