Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GCNAQ96QF7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GCNAQ96QF7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GCNAQ96QF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GCNAQ96QF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GCNAQ96QF7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms