Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAPPC9Q96Q05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC9Q96Q05 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms