Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOPNLQ96NB1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOPNLQ96NB1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOPNLQ96NB1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOPNLQ96NB1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOPNLQ96NB1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOPNLQ96NB1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOPNLQ96NB1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms