Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX1

C4orf36, Uncharacterized protein C4orf36, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf36Q96KX1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C4orf36Q96KX1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4orf36Q96KX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C4orf36Q96KX1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4orf36Q96KX1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms