Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKNOX2Q96KN3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKNOX2Q96KN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PKNOX2Q96KN3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKNOX2Q96KN3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms