Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COX4I2Q96KJ9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COX4I2Q96KJ9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COX4I2Q96KJ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COX4I2Q96KJ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COX4I2Q96KJ9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms