Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ZNF479Q96JC4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ZNF479Q96JC4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF479Q96JC4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms