Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ZC2HC1AQ96GY0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ZC2HC1AQ96GY0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZC2HC1AQ96GY0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZC2HC1AQ96GY0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms