Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX27Q96GQ7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.57■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.53■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX27Q96GQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DDX27Q96GQ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDX27Q96GQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDX27Q96GQ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms