Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCMH1Q96GD3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCMH1Q96GD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCMH1Q96GD3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms