Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SIPA1Q96FS4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIPA1Q96FS4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIPA1Q96FS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SIPA1Q96FS4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms