Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMIM19Q96E16 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMIM19Q96E16 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMIM19Q96E16 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMIM19Q96E16 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms