Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC74AQ96AQ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC74AQ96AQ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC74AQ96AQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC74AQ96AQ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC74AQ96AQ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
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