Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
VTI1AQ96AJ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
VTI1AQ96AJ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
VTI1AQ96AJ9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
VTI1AQ96AJ9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
VTI1AQ96AJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms