Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFT1Q96AA3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFT1Q96AA3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFT1Q96AA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFT1Q96AA3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms