Protein–RNA interactions for Protein: Q96A49

SYAP1, Synapse-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYAP1Q96A49 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SYAP1Q96A49 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SYAP1Q96A49 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SYAP1Q96A49 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SYAP1Q96A49 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SYAP1Q96A49 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SYAP1Q96A49 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms