Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFKQ969G6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RFKQ969G6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RFKQ969G6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RFKQ969G6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms