Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HPS3Q969F9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HPS3Q969F9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HPS3Q969F9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HPS3Q969F9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HPS3Q969F9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HPS3Q969F9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms