Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MR1Q95460 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MR1Q95460 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MR1Q95460 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MR1Q95460 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MR1Q95460 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MR1Q95460 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MR1Q95460 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MR1Q95460 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MR1Q95460 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MR1Q95460 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MR1Q95460 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MR1Q95460 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MR1Q95460 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MR1Q95460 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MR1Q95460 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MR1Q95460 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MR1Q95460 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MR1Q95460 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MR1Q95460 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
MR1Q95460 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MR1Q95460 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MR1Q95460 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MR1Q95460 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MR1Q95460 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MR1Q95460 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MR1Q95460 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MR1Q95460 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MR1Q95460 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MR1Q95460 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24■■□□□ 1.43
MR1Q95460 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MR1Q95460 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MR1Q95460 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MR1Q95460 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MR1Q95460 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MR1Q95460 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MR1Q95460 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MR1Q95460 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MR1Q95460 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MR1Q95460 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MR1Q95460 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MR1Q95460 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MR1Q95460 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MR1Q95460 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MR1Q95460 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MR1Q95460 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MR1Q95460 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MR1Q95460 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MR1Q95460 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MR1Q95460 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MR1Q95460 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MR1Q95460 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MR1Q95460 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MR1Q95460 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MR1Q95460 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MR1Q95460 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MR1Q95460 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MR1Q95460 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MR1Q95460 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MR1Q95460 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MR1Q95460 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MR1Q95460 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MR1Q95460 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MR1Q95460 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MR1Q95460 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MR1Q95460 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MR1Q95460 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MR1Q95460 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MR1Q95460 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MR1Q95460 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MR1Q95460 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MR1Q95460 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MR1Q95460 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MR1Q95460 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MR1Q95460 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MR1Q95460 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MR1Q95460 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MR1Q95460 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MR1Q95460 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MR1Q95460 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MR1Q95460 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MR1Q95460 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MR1Q95460 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MR1Q95460 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MR1Q95460 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MR1Q95460 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms