Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RAD50Q92878 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAD50Q92878 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RAD50Q92878 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
RAD50Q92878 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAD50Q92878 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms