Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKL2Q92772 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDKL2Q92772 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDKL2Q92772 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDKL2Q92772 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDKL2Q92772 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms