Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TTC9Q92623 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TTC9Q92623 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC9Q92623 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC9Q92623 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TTC9Q92623 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms