Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX19Q92543 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SNX19Q92543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNX19Q92543 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SNX19Q92543 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNX19Q92543 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNX19Q92543 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms