Protein–RNA interactions for Protein: Q92485

SMPDL3B, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3BQ92485 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMPDL3BQ92485 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SMPDL3BQ92485 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SMPDL3BQ92485 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SMPDL3BQ92485 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SMPDL3BQ92485 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms