Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
C1orf54Q8WWF1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
C1orf54Q8WWF1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
C1orf54Q8WWF1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C1orf54Q8WWF1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C1orf54Q8WWF1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms