Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMBR1Q8WVP7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LMBR1Q8WVP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
LMBR1Q8WVP7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LMBR1Q8WVP7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LMBR1Q8WVP7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.2 ms