Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM171Q8WVE6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM171Q8WVE6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM171Q8WVE6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM171Q8WVE6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM171Q8WVE6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM171Q8WVE6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM171Q8WVE6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms