Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDD1Q8TEB9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHBDD1Q8TEB9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHBDD1Q8TEB9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RHBDD1Q8TEB9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms