Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNFQ8TB73 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNFQ8TB73 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDNFQ8TB73 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NDNFQ8TB73 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms