Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PJA1Q8NG27 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PJA1Q8NG27 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PJA1Q8NG27 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PJA1Q8NG27 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PJA1Q8NG27 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms