Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms