Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF548Q8NEK5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF548Q8NEK5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF548Q8NEK5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF548Q8NEK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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