Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MFSD2AQ8NA29 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MFSD2AQ8NA29 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MFSD2AQ8NA29 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFSD2AQ8NA29 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MFSD2AQ8NA29 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms