Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LNX2Q8N448 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LNX2Q8N448 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LNX2Q8N448 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LNX2Q8N448 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LNX2Q8N448 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms