Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00528Q8N1L1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00528Q8N1L1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00528Q8N1L1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms