Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ21

PHACTR4, Phosphatase and actin regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR4Q8IZ21 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR4Q8IZ21 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR4Q8IZ21 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR4Q8IZ21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR4Q8IZ21 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms