Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MARCH9Q86YJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MARCH9Q86YJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH9Q86YJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH9Q86YJ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH9Q86YJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH9Q86YJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH9Q86YJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MARCH9Q86YJ5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH9Q86YJ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MARCH9Q86YJ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms