Protein–RNA interactions for Protein: Q86W33

TPRA1, Transmembrane protein adipocyte-associated 1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRA1Q86W33 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRA1Q86W33 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPRA1Q86W33 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPRA1Q86W33 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRA1Q86W33 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms