Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD163Q86VB7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD163Q86VB7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD163Q86VB7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD163Q86VB7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms