Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RPAINQ86UA6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RPAINQ86UA6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPAINQ86UA6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPAINQ86UA6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPAINQ86UA6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPAINQ86UA6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms